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依据bed文件生成bdg文件

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caq_bdg_maker

依据bed文件生成bdg文件

欢迎使用!!!!!!!!!!!!!

本软件可以使用一个或者多个bed文件来生成对应的bdg文件

在使用前你应该知道以下几点:

1.请使用sorted的bed文件进行运行,否则结果文件不会正确

2.bdg_maker.py为生成bdg文件的主程序,但是在使用此之前,请确保使用的bed文件都使用了bed_caqidx_maker.py生成了后缀名为caqidx的索引文件

3.生成出的bdg文件每行对应一个碱基位置,即使本可以和后面一行进行合并,但是此程序没有进行此处理

bed_caqidx_maker.py使用教程:

请在运行前使用文本浏览器打开

path后面的字符串为进行运行的路径

offset可根据自己需求进行调节

bdg_maker.py使用教程: 请在运行前使用文本浏览器打开

file_path_list为即将进行运算的列表,即使只有一个文件也请以列表格式写入

例子:

单个文件:[r'C:\sra.bed']

多个文件:[r'C:\sra.bed',r'ras.bed']

out_path为输出文件路径

out_dict为另类输出文件路径,不希望输出此文件请写为out_dict=r''

how_many_legth_once,fail_time_max可根据自己需求进行调节

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