依据bed文件生成bdg文件
欢迎使用!!!!!!!!!!!!!
本软件可以使用一个或者多个bed文件来生成对应的bdg文件
在使用前你应该知道以下几点:
1.请使用sorted的bed文件进行运行,否则结果文件不会正确
2.bdg_maker.py为生成bdg文件的主程序,但是在使用此之前,请确保使用的bed文件都使用了bed_caqidx_maker.py生成了后缀名为caqidx的索引文件
3.生成出的bdg文件每行对应一个碱基位置,即使本可以和后面一行进行合并,但是此程序没有进行此处理
bed_caqidx_maker.py使用教程:
请在运行前使用文本浏览器打开
path后面的字符串为进行运行的路径
offset可根据自己需求进行调节
bdg_maker.py使用教程: 请在运行前使用文本浏览器打开
file_path_list为即将进行运算的列表,即使只有一个文件也请以列表格式写入
例子:
单个文件:[r'C:\sra.bed']
多个文件:[r'C:\sra.bed',r'ras.bed']
out_path为输出文件路径
out_dict为另类输出文件路径,不希望输出此文件请写为out_dict=r''
how_many_legth_once,fail_time_max可根据自己需求进行调节